学院设有经济管理系、经济贸易系、财会金融系、政治法律系、信息管理系、公务员培训部、经济管理培训部、继续教育中心等多个部门和科研机构。学院先后开设了大学本科起点的工业企业管理专业高级研究班，大专起点的工商企业管理、经济法专业本科班和企业生产经营管理、工商管理、质量与经营、营销与财务管理、国际商务、证券投资、财务会计、物业管理、电子商务、连锁经营、金融理财、经济贸易、文秘与办公自动化、计算机与信息管理、律师实务、行政管理、工商行政管理、经济法等30多个专业大专层次的成人班及相应专业的高等职业技术教育普通班。1998年，学院成为全国首批举办专科函授教育的12所成人高校之一，开办了经济管理、会计学两个专业的专科函授。此外，自1989年起，学院与江西师范大学联合招收西方管理哲学硕士研究生（教学点设在我院）；1993年，与英国strathclyde大学建立了教学、科研的合作关系；1999年7月与厦门大学签订两校合作办学协议，进一步加强与国内大学的学术交流。
学院的学历教育办学规模达四千三百人，拥有专职教师194名（其中教授10名、副教授59名、讲师97名），同时聘请了40多名国内外专家、学者以及领导干部为兼职教授或客座教授，形成了一支专兼结合、结构合理、学科门类齐全的师资队伍。学院占地182.6亩，建筑面积平方米，配备了图书馆、电教室、语音室、管理实验室、会计实验室、证券实验室、电子计算机室等现代化教学设施。图书馆藏书20万余册，并订阅了数百种能及时反映管理科学发展最新动态的中外期刊、文献、资料。在校外梅峰井边亭，建有一幢面积达1.35万平方米的智能化干部培训大楼。
福建经济管理干部学院还是福建省管理教育研究会、福建省经济管理干部教育研究会、省企业管理咨询研究会的挂靠单位，在组织和开展经济管理人才教育培训、管理教育研究和企业管理咨询等方面发挥着越来越重要的作用。面向即将到来的21世纪，学院正以崭新的精神面貌，进一步加快改革、建设和发展步伐，努力为福建经济腾飞、社会进步做出更大的贡献。