第三次忍界大战极其惨烈，损失巨大。人员伤亡方面，风之国的三代目风影被蝎杀害，致使砂隐村群龙无首，陷入混乱；雷之国的三代目雷影为掩护同伴，孤身对抗一万名土之国敌军，奋战三天三夜后力竭而死。土之国的诸多岩隐村忍者在与木叶的交战中全部阵亡，水之国的第一批忍刀七人众 4 死 3 逃、暗部成员全部阵亡，火之国的防御部队也损失惨重，美村叶卷所率部队最后仅剩四人，迈特戴为保护同伴与雾隐村的第一批忍刀七人众战斗，最终牺牲，宇智波带土下落不明，野原琳也不幸死亡。此外，战争还导致各国经济受到重创，大量的村庄、城镇被破坏，基础设施损毁严重，重建工作需要耗费大量的人力、物力和时间。而且，战争对人们的心灵造成了巨大创伤，许多忍者和普通民众失去了亲人、朋友，年幼的宇智波鼬目睹了战争的惨烈，这对其性格成长产生了深远影响。
在木叶村的一次重要会议上，有部分忍者认为三代火影猿飞日斩在第三次忍界大战中的指挥存在一些问题，导致木叶村遭受了较大的损失，因此提议让三代火影引咎退位，以便选出一位更适合的火影来领导木叶村走向复兴。当时，大蛇丸作为三代火影的弟子之一，实力虽强但野心勃勃，一直渴望掌握更强大的忍术和力量，甚至不惜进行诸多危险且违背道德伦理的人体实验，其行为严重威胁到了木叶村的稳定和安全。若让大蛇丸成为火影，木叶村极有可能陷入更大的危机之中。
而波风水门则是一位天才忍者，他不仅实力强大，还具备出色的领导才能和高尚的品德。他在神无毗桥之战等战役中的卓越表现，以及凭借飞雷神之术等强大忍术立下的赫赫战功，让他深受村民们的信赖和尊敬 。综合各方面因素，木叶村最终选择了波风水门作为第四代火影，期待他能够带领木叶村走向更加繁荣昌盛的未来。