孙悟空与玉帝处理完仙界边缘的黑暗生物事件后，立刻将消息传递给了佛界、魔界和妖界。四大界域闻讯，再度紧张起来，纷纷加强了各自领地的巡逻与防御。
孙悟空决定深入调查这股黑暗残余势力的根源，他先来到了妖界。清风早已召集了妖界中擅长追踪气息和打探情报的妖怪。孙悟空向他们详细描述了那股黑暗气息的特征，众妖怪领命后，迅速分散开来，凭借着敏锐的感知，在妖界的各个角落探寻线索。
与此同时，孙悟空又赶往魔界。魔帝听闻此事，立刻派出七大魔帅，带领魔界的精锐部队，在魔界的黑暗深渊、废弃魔窟等可能藏匿黑暗余孽的地方展开地毯式搜索。魔帝自己也亲自坐镇，指挥全局，一旦有任何发现，便能迅速做出应对。
在佛界，如来佛祖派遣观音菩萨率领一众罗汉，以佛法之力净化可能存在黑暗气息的区域。他们每到一处，都会仔细感知周围的灵力波动，不放过任何一丝异常。观音菩萨还发动佛界的信众，让他们留意身边的奇异现象，一旦发现与黑暗势力有关的蛛丝马迹，立刻上报。
仙界这边，玉帝下令扩大监测范围，将仙界的巡逻队伍增加了数倍。不仅在仙界边缘，就连仙界内部的各个灵脉、仙岛都安排了重兵把守。太上老君则日夜炼制能够追踪黑暗气息的丹药，只要黑暗余孽有所行动，便能通过丹药的反应找到他们的踪迹。
孙悟空在四大界域间来回奔波，协调各方行动。数日后，妖界传来消息，一只擅长追踪气味的狐妖在妖界的一处古老遗迹中，发现了与之前相似的黑暗气息。孙悟空立刻赶到，只见遗迹中弥漫着一股腐朽的味道，墙壁上刻满了奇怪的符文，这些符文闪烁着微弱的黑暗光芒。
孙悟空沿着气息的源头深入遗迹，突然，一群黑影从四面八方涌出。这些黑影比之前遇到的黑暗生物更加敏捷，它们手中握着黑暗利刃，朝着孙悟空和狐妖扑来。孙悟空迅速挥动金箍棒，与黑影展开激战。狐妖则在一旁施展魅惑之术，试图扰乱黑影的行动。
在战斗中，孙悟空发现这些黑影似乎是由黑暗怨念凝聚而成，普通的攻击只能暂时打散它们。于是，他施展出更强的法力，金箍棒上燃起熊熊火焰，将黑影一一灼烧殆尽。
继续深入遗迹，孙悟空在一个密室中发现了一本散发着黑暗气息的古籍。古籍的封面上刻着一些奇异的符号，孙悟空虽不认识，但他能感觉到这本古籍与黑暗势力的阴谋有着密切的关系。
就在孙悟空准备带走古籍时，密室突然剧烈震动，一道黑暗之门缓缓打开。门内走出一个身着黑袍的人，他的面容隐藏在阴影之中，看不清模样。