对于伊势北畠家来说，当今朝廷是曾经被称之为‘伪朝’的北朝一脉，而足利将军家更是列祖列宗的宿敌，就算站在其对立面，那也是非常合理的。
更何况，伊势北畠家家祖北畠显能之父北畠亲房是村上源氏久我氏流出身，还出任过南朝的源氏长者、淳和奖学两学院别当（淳和奖学两院别当是源氏长者配下的两个院所在京都附近的领地食邑，在平安时期这两个院所的食邑绝对是所有公卿最为眼馋的肥缺，只不过到后来幕府将军手中，则是纯粹成为锦上添花的装饰品罢了），更是作为后醍醐天皇亲信公卿的‘后三房（万里小路宣房、吉田定房、北畠亲房，与平安后期后三条天皇时代的“三房”，即藤原伊房、藤原为房、大江匡房相对）’之一。
北畠亲房在持明院统的伏见院政期担任检非违使别当，到了后宇多院政期，开始接近大觉寺统。后醍醐天皇亲政不久，再度被任命为检非违使别当，主管京都周边的市政，兼任后醍醐所宠爱的世良亲王的乳父（负责养育），但未参与以日野资朝为中心的倒幕计划。元德二年（1330）世良亲王去世后，北畠亲房便剃发出家，暂时退出了政治舞台。直到镰仓幕府灭亡、建武政权成立后，他又成为准大臣，与担任陆奥守的儿子北畠显家一起陪同义良亲王前往陆奥国多贺（今宫城县多贺城市），参与管理奥州之地，后成为“南朝的柱石”。
最为讽刺的是，北畠亲房曾在记录官职形态和规范的作品《职原抄》中批判了后醍醐天皇的人事政策，希望能唯才是举，并不一定重视按门第任官。正因如此，即便在北朝一方，北畠亲房所著的《神皇正统记》、《职原抄》也未被视作南朝正统论，而是被视作表现公家社会规矩的书，得到接受、讲解、注释甚至增补，还被当作官制的样板，以资参考。
再加上，足利将军家先后任命的畠山高国、高师秋、仁木义长、石塔赖房、细川清氏（后隶属于南朝方）、土岐赖康、细川赖之、细川满之（细川备中守家家祖）等诸多重臣为伊势守护职，可都因为各种各样的缘由，非但没能击败伊势北畠家，反而让伊势北畠家得以在南伊势五郡之中站稳脚跟，甚至还进而向大和宇陀郡、纪伊牟娄郡、伊贺伊贺郡等邻近地区扩张势力。
即便在南北朝以后，南朝的痕迹也并未完全消失，仍然不时被人提起，作为旗帜对抗以京都为中心的政治秩序，世人称之为‘后南朝’。
当然，北畠晴具、北畠具教父子二人很早就看出上杉家与足利将军家之间的关系是每况愈下，打算迅速拉近与上杉家之间的关系，便派遣同族重臣北畠政成作为使者，出使上杉家本据小田原城，将伊势北畠家至今庇护南朝皇室末裔之事告知上杉清定。
毕竟，伊势北畠家可不止一次拥立南朝皇室向朝廷、足利将军家举起反旗。
单单是第三代伊势北畠家家督北畠满雅，就分别在应永二十一年（1414年）、正长元年（1428年）两次拥立南朝小仓宫一脉的皇室向朝廷、足利将军家举起反旗。